2006年邵逸夫奖颁奖典礼9月12日晚在香港会展中心隆重举行。香港特别行政区行政长官曾荫权和邵逸夫奖创办人邵逸夫爵士，为来自美国、澳大利亚、中国的6位科学家颁奖。邵逸夫数学奖评奖委员会主席Michael Atiyah爵士介绍了吴文俊研究员与同时获的数学奖的David Mumford教授的研究工作。特首曾荫权和邵逸夫爵士向吴文俊研究员颁奖。